Строение белков

Число возможных пептидов 20n n - количество аминокислот в пептиде.
Белки составляют ~1/2 сухой массы клетки
вторичная структура обусловлена H-связями между NH и CO скелета первичной структуры и не зависит от –Rтретичная структура зависит от взаимодействия между R: S-S-связи, ионные, Н-связи, гидрофобные взаимод
Полипептидные структуры

a-спираль
число остатков на один оборот 3,6
шаг 0,54нм (диаметр спирали 5,4 A)
радиус 0,23нм
угол 260
коэф. трансляции 0,15нм (расстояние между остатками по оси 1,5A)
угол поворота 1000
периодичность 5
запрещенные положения а-спирали: 1,2; 1,4; 1,5 – не должно быть больших гидрофобных аминокислот (Tyr-Tyr, Val-Tyr, Ile-Tyr) – спираль будет напрягаться и искажаться
спираль мб лево- и правозакрученная, все исследованные белки правозакрученные
длина как правило ~40A, но достигает 1000A
две или более спирали могут закручиваться вокруг как в канате – а-спирализованная суперспираль (кератин волос, миозин,
тропомиозине мышц, фибрине)
в-слой
параллельный и антипараллельный (более устойчивый)
спираль коллагена
в-изгиб
в глобулах направление цепей меняется на 1800 – СO присоединяется ч-з 3а-кты к NH
Изгибы обеспечиваются Pro, или большими гидрофобными аминокислотами: Tyr, Val, Ile.
В полипептиде вращение возможно вокруг любой связи | Гидрофобная внутренняя часть плотно упаковывается (как кристалл) образуя кор, гидрофильная внешняя часть белка образует сложную поверхность | Белки делятся на глобулярные-95% и фибриллярные-5% | большинство глобулярных б р-римо, а фибриллярных нер-римо | модели белков: объемная, скелетная, лентовидная, сосисочная-показ. ход полипептидной цепи | Конформацию белка можно определить только с помощью рентгеноструктурного анализа белков | связи в полипептиде: м-у заряж. актами, водородные, S-S-связи | В цитозольных белках S-S-связей мало из-за высокой конц глутатиона кот. восстанавливает SH-группы||
-слой образ. сердцевину (core) белков

антипараллельный -слой часто служит каркасом на кот собирается глобулярный белок
параллельный -слой часто бывает накрыт с 2-х сторон -спиралями
-спираль обнаружена в кератине | фенол денатурирует белки до первичной структуры | коагуляция - осаждение белков | этанол, ацетон, р-ры нек солей (MgSO4 (NH4)2SO4 Na2SO4) обратимо коагулируют белки, в воде снова образ коллоидный р-р. Необратимую коагуляцию (денатурацию) белка вызывает кипячение, минеральные кты, пикриновая кты, соли тяжелых ме, танин – необратимая коагуляция-денатурация
Протеины: альбумины хорошо р-ряются в воде (молоко, яичный белок, кровь); глобулины в воде не р-ряются, р-римы в разбавл р-рах солей (глобулины крови, миозин); глутелины р-ряются в разб щелочах (в растениях); склеропротеины — нер-римы (кератины, коллаген, белок натурального шелка фиброин) | Протеиды - протеины, соед с мол-лами др типа (простетические группы): фосфопротеиды сод мол-лы фосфорной кты, связанные в виде сложного эфира у ОН-группы серина (вителлин—белок
в яичном желтке, казеин); гликопротеиды сод остатки углеводов, входят в состав хрящей, рогов, слюны; хромопротеиды сод мол-лу окраш в-ва типа порфина (гемоглобин); нуклеопротеиды — связаны с нк (вирусы)
определение актного состава - метод гидролиза (6-10М HCl t100°С) получ смесь акт кот можно разделить | для кол-венного анализа применяют ионообменную и бумажную хроматографию Нек ф-ты расщеп белок специфически —в местах опред акты-->получ продукты ступенчатого расщепления — пептоны и пептиды, анализом кот опред актный состав | для опред послед-ти акт опредляют N- и С-концы пидных цепей определяя концевые акты и число пидных цепей. Для опред N-концов получают N-производное концевой акты, кот идентифицируют после полного гидролиза пептида. С-концы пептидных цепей опред избирательным отщеплением концевой акты с помощью ф-та — карбоксипептидазы и идентификацией этой акты Если белок из неск пептидов, то разрушают S-S-мостики окислением (над-муравьиной ктой) и затем полученные пиды
разделяют путем фракционирования на ионитах. Для определения последовательности расположения аминокислот в каждой полипептидной цепи ее подвергают частичному кислотному гидролизу и избирательному расщеплению с помощью ферментов, каждый из которых разрывает полипептидную цепь только в определенных местах присоединения какой-то одной определенной аминокислоты или одного типа аминокислот (основных, ароматических). Таким образом получают несколько наборов пептидов: которые разделяют, используя методы хроматографии и электрофореза. Строение коротких пептидов определяют последовательным отщеплением и идентификацией концевых аминокислот упомянутыми выше методами, а большие пептиды подвергают дополнительному расщеплению с последующим разделением и определением строения. Затем путем сложного сопоставления структуры различных участков пептидной цепи воссоздают полную картину расположения аминокислот в макромолекуле белка.
ОПРЕДЕЛЕНИЕ НАЛИЧИЯ БЕЛКА: биуретовая реакци, ксантопротеиновая
реакция (желтое окраш при действии конц HNO3, кот в присутствии аммиака становится оранжевым - нитрование остатков фенилаланина и тирозина); реакция Миллона (желто-коричневое окраш при действии с Hg(NI3)2+HNО3+HNO2, нингидриновая реакция, t белков с солями свинца-->черный осадок PbS если акты сод S, сильное нагревание вызывает разложение белков с выделением летучих продуктов, обладающих запахом жженых перьев.

Литература: 

К сожалению, список литературы отсутствует.