Просмотр 3D-молекул

Пример структуры как она выглядит в программе

Для просмотра 3D-молекул необходимо закачать архив программы RasWin и распаковать его на ваш компьютер.
Теперь вы можете просматривать изображения молекул в формате .pdb
Чтобы попробовать закачайте файл cellulos.pdb
Если у вас не получается открыть закаченный файл щелкните по нему правой кнопкой мыши, выберете в меню - открыть с помощью, выбрать программу, обзор, отыщите RasWin, укажите всегда открывать файлы такого типа этой программой.
Некоторые файлы вы сможете найти на нашем сайте в соответствующих обзорах.
Файлы можно также искать в базе данных ]]>Protein Data Base (PDB)]]>. Для того чтобы найти интересующую вас структуру необходимо в окне поиска набрать код структуры или название, например, 132L - лизоцим. В открывшемся окне, найти ссылку на файл .pdb, который откроется в окне вашего браузера. Скопируйте весь текст в блокнот и сохраните как name.pdb (не забудьте изменить при сохранении 'текстовые файлы' на 'все файлы', чтобы изменить разрешение). Приятного вам просмотра!
Для атомов пространственных моделей приняты следующие цвета:
H - белый, O - красный, С- серый, N - синий, P - оранжевый, S - желтый.


Коды некоторых интересных структур

132L - Лизоцим
1AAY - Цинковый палец
1COO - РНК-полимераза
1BBE - Коллаген
1C3W - Бактериородопсин
1HGA - Гемоглобин
7ICG - ДНК-полимераза
1A29 - Кальмодулин
1A0S - Порин
1C1G - Тропомиозин
1I6H - РНК-полимераза II синтезирующая РНК по матрице ДНК. Двухцепочечная ДНК входит в фермент, раскручивается перед активным центром фермента. В пределах активного центра существует дуплекс ДНК-РНК длинной 9 пн. 3'-конец РНК располагается над порой, через которую РНК выходит из фермента. Виден желоб в который входит и выходит ДНК и выходит РНК.

Прикрепленный файлРазмер
cellulos.pdb5.51 кб
raswin.exe_.gz244 кб
admin аватар

Ссылки и файлы добавлены. Прошу прощения за столь долгое ожидание