Биология

"Биология" для математиков, для лучшего понимания процессов происходящих в живых организмах.

Escherichia coli

Escherichia coli самый популярный объёкт исследований у математических биологов.

Базы данных

База данных Escherichia coli

]]>http://www.ecocyc.org]]>

База данных метаболизма огромного количества организмов

]]>http://www.genome.jp/kegg/]]>

Количественная база данных Escherichia coli

]]>http://redpoll.pharmacy.ualberta.ca/CCDB/cgi-bin/STAT_NEW.cgi]]>

База данных Escherichia coli в Википедии

]]>http://ecoliwiki.net/colipedia/index.php/Welcome_to_EcoliWiki]]>

Характеристика Escherichia coli

]]>http://bioweb.uwlax.edu/bio203/s2008/moder_just/index.htm]]>

Ресурс Escherichia coli

]]>http://www.ecolicommunity.org]]>

Ресурс About the E. coli Genome Project at UW-Madison

]]>http://www.genome.wisc.edu/aboutus.htm]]>

Ресурс Нуклеотиды

]]>http://www.rpi.edu/dept/bcbp/molbiochem/BiochSci/sbello/nucleotides.htm]]>

Ресурс E-Coli Bacterium

]]>http://www.geocities.com/ameztv/]]>

Ресурс International E.coli Alliance
E.coli Database Portal

]]>http://www.uni-giessen.de/ecoli/IECA/index.php]]>

Ресурс всех баз 2009 NAR Database Summary Papers

]]>http://www3.oup.co.uk/nar/database/cap/]]>

<База знанийо человеке

]]>http://humbio.ru/]]>

База математических моделей в формате SBML, конвертированных из базы
метаболических путей KEGG

]]>http://www.systems-biology.org/001/001.html]]>

База математических моделей ГС, сгенерированных на основе генетического
алгоритма

http://sbw.kgi.edu/ModelDB/

База данных сигнальных путей и их математических моделей в формате GENESIS

]]>http://doqcs.ncbs.res.in/]]>

База данных математических моделей в формате SBML (~200 моделей)

]]>http://www.biomodels.net/]]>

База моделей в формате CellML (~300 моделей)

]]>http://www.cellml.org/models/]]>

База моделей JWS Online (~100 моделей), формат SBML и Pysces

]]>http://jjj.biochem.sun.ac.za/database/index.html]]>

История

Кишечные палочки ( Бактерии группы кишечных палочек)
В 1885 г. Эшерих открыл микроорганизм, который получил название Escherichia coli (кишечная палочка). Этот микроорганизм является постоянным обитателем толстого отдела кишечника человека и животных. Кроме Е. coli, в группу кишечных бактерий входят эпифитные и фитопатогенные виды, а также виды, экология (происхождение) которых пока не установлена. К бактериям группы кишечных палочек относят роды Escherichia (типичный представитель Е. coli), Citrobacter (типичный представитель Citr. coli citrovorum), Enterobacter (типичный представитель Ent. aerogenes), которые объединены в одно семейство Enterobacteriaceae благодаря общности морфологических и культуральных свойств. Они характеризуются различными ферментативными свойствами и антигенной структурой.

Морфология.



Бактерии группы кишечных палочек - это короткие (длина 1-3 мкм, ширина 0,5-0,8 мкм) полиморфные подвижные и неподвижные грамотрицательные палочки, не образующие спор.


Культуральные свойства.



Бактерии хорошо растут на простых питательных средах: мясопептонном бульоне (МПБ), мясопептонном агаре (МПА). На МПБ дают обильный рост при значительном помутнении среды; осадок небольшой, сероватого цвета, легкоразбивающийся.Образуют пристеночное кольцо, пленка на поверхности бульона обычно отсутствует. На МПА колонии прозрачные с серовато-голубым отливом, легко сливающиеся между собой. На среде Эндо образуют плоские красные колонии средней величины. Красные колонии могут быть с темным металлическим блеском (Е. coli) или без блеска (E.aerogenes). Для лактозоотрицательных вариантов кишечной палочки (B.paracoli) характерны бесцветные колонии. Им свойственна широкая приспособительная изменчивость, в результате которой возникают разнообразные варианты, что усложняет их классификацию.


Биохимические свойства.



Большинство бактерий группы кишечных палочек не разжижают желатина, свертывают молоко, расщепляют пептоны с образованием аминов, аммиака, сероводорода, обладают высокой ферментативной активностью в отношении лактозы, глюкозы и других сахаров, а также спиртов. Не обладают оксидазной активностью. По способности расщеплять лактозу при температуре 37°С БГКП делят на лактозоотрицателъные и лактозоположительные кишечные палочки (ЛКП), или колиформные, которые формируются по международным стандартам. Из группы ЛКП выделяются фекальные кишечные палочки (ФКП), способные ферментировать лактозу при температуре 44,5°С . К ним относится Е. coli, не растущая на цитратной среде.


Устойчивость.



Бактерии группы кишечных палочек обезвреживаются обычными методами пастеризации (65 - 75° С). При 60° С кишечная палочка погибает через 15 минут. 1% раствор фенола вызывает гибель микроба через 5-15 минут, сулема в разведении 1:1000 - через 2 мин., устойчивы к действию многих анилиновых красителей.


Санитарно-показательное значение.



Санитарно-показательное значение отдельных родов бактерий группы кишечных палочек неодинаково. Обнаружение бактерий рода Escherichia в пищевых продуктах, воде, почве, на оборудовании свидетельствует о свежем фекальном загрязнении, что имеет большое санитарное и эпидемиологическое значение. Считают, что бактерии родов Citrobacter и Enterobacter являются показателями более давнего (несколько недель) фекального загрязнения и поэтому они имеют меньшее санитарно-показательное значение по сравнению с бактериями рода Escherichia. При длительном применении антибиотиков в кишечнике человека также обнаруживают различные варианты кишечной палочки. Особый интерес представляют лактозоотрицателъные варианты кишечной палочки. Это измененные эшерихии, утратившие способность сбраживать лактозу. Они выделяются при кишечных инфекциях человека (брюшном тифе, дизентерии и др.) в период выздоровления. Наибольшее санитарно-показательное значение имеют кишечные палочки, не растущие на среде Козера (цитратная среда) и ферментирующие углеводы при 43-45°С (E. coli).Они являются показателем свежего фекального загрязнения. В связи с неодинаковым санитарно-показательным значением отдельных родов бактерий группы кишечных палочек их дифференцируют на основании следующих признаков, образующих комплекс ТИМАЦ


Источники



  1. Р.П. Корнелаева, ПП. Степаненко, Е.В. Павлова Санитарная микробиология сырья и продуктов животного происхождения. 2006, с.15-18
  2. ]]>http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%B8%D1%88%D0%B5%D1%87%D0%BD%D0%B0%...]]>

Систематика

Domain (Царство):

Bacteria (Бактерии)

Phylum (Тип):

Proteobacteria (Протеобактерии)

Class (Класс):

Gamma Proteobacteria (Гамма-протеобактерии)

Order (Порядок):

Enterobacteriales

Family (Семейство):

Enterobacteriaceae

Genus (Род):

Escherichia

Species (Вид):

Escherichia coli (Кишечная палочка)

Литература: 

К сожалению, список литературы отсутствует.

Снимки

Литература: 

К сожалению, список литературы отсутствует.

Литература

Прикрепленный файлРазмер
№1_Аминокислоты.doc97.5 кб
№2_Нуклеотиды.doc1.13 Мб

Методы

Литература: 

К сожалению, список литературы отсутствует.