Геном эукариот
Геном человека
У человека 23 пары хромосом, 22 аутосомы и 1 пара половых XX (женский пол) или XY (мужской пол).
Гаплоидный геном человека включает более 3 биллионов пар оснований ДНК, общей длинной приблизительно 1,8 м. Полный объем информации записанной в ДНК человека занимает около 750 мегабайт.
Гаплоидный геном человека содержит около 20,000–25,000 генов кодирующих белки.
Около 1.5% генома белок кодирующая, в то время как остальная ДНК включает регуляторные последовательности, интроны, РНК кодирующие последовательности, различные повторы и т.д.
~8% генома приходится на инактивированные последовательности некогда функционировавших ретровирусов HERV (Human endogenous retrovirus), самым молодым из которых, HERV-K, около 5-ти миллионов лет.
Французские исследователи восстановили последовательность одного из ретровирусов семейства HERV-K, содержащиеся в геноме. В клетках линии 239Т происходила транскрипция вирусной ДНК и продукция вирусных частиц. Более того, сам вирус, получивший название Phoenix, оказался способным самостоятельно осуществлять полный ретровирусный цикл от заражения клетки до интеграции в геном и сборки вирусных частиц. В некоторых опухолях, таких как тератокарцинома и меланома, экспрессируются отдельные белки HERV. Этого не достаточно для сборки полноценного вируса - слишком много мутаций. Однако, "воскрешение" полноценного вируса вполне может произойти за счет спонтанной рекомбинации - принципиальная возможность этого подтверждается результатами французских ученых.
Хромосома | Генов | Длина, пн | Секвенировано |
1 | 3,148 | 247,200,000 | 224,999,719 |
2 | 902 | 242,750,000 | 237,712,649 |
3 | 1,436 | 199,450,000 | 194,704,827 |
4 | 453 | 191,260,000 | 187,297,063 |
5 | 609 | 180,840,000 | 177,702,766 |
6 | 1,585 | 170,900,000 | 167,273,992 |
7 | 1,824 | 158,820,000 | 154,952,424 |
8 | 781 | 146,270,000 | 142,612,826 |
9 | 1,229 | 140,440,000 | 120,312,298 |
10 | 1,312 | 135,370,000 | 131,624,737 |
11 | 405 | 134,450,000 | 131,130,853 |
12 | 1,330 | 132,290,000 | 130,303,534 |
13 | 623 | 114,130,000 | 95,559,980 |
14 | 886 | 106,360,000 | 88,290,585 |
15 | 676 | 100,340,000 | 81,341,915 |
16 | 898 | 88,820,000 | 78,884,754 |
17 | 1,367 | 78,650,000 | 77,800,220 |
18 | 365 | 76,120,000 | 74,656,155 |
19 | 1,553 | 63,810,000 | 55,785,651 |
20 | 816 | 62,440,000 | 59,505,254 |
21 | 446 | 46,940,000 | 34,171,998 |
22 | 595 | 49,530,000 | 34,893,953 |
X | 1,093 | 154,910,000 | 151,058,754 |
Y | 125 | 57,740,000 | 22,429,293 |